FECAPEQ fue creada formalmente el 30 de septiembre de 1983 a iniciativa del Lic. Edgardo Cabrera Delgado, entonces presidente del Colegio de Abogados Litigantes de Querétaro.

Entre los fundadores se encontraban el Colegio de Arquitectos de Querétaro, presidido por el Arq. Alejandro Cortés Soto, el Colegio de Ingenieros Civiles de Querétaro, presidido por el Ing. Carlos Urbiola Basaldúa.

El Colegio de Contadores Públicos, presidido por el C.P. Salvador Septién Barrón, el Colegio de Cirujanos Dentistas de Querétaro, presidido por el Dr. Roberto A. Wuotto, el Colegio de Médicos de Querétaro, presidido por el Dr. Salvador Guerrero Servín.

También fueron fundadores el Instituto Mexicano de Valuación de Querétaro, presidido por el Ing. Ruy J. Madero y el Colegio de Ingenieros, Mecánicos y Electricistas, Sección Querétaro, presidido por el Ing. Agustín Estrada.

La FECAPEQ es ampliamente reconocida por autoridades federales, estatales y locales, así como la sociedad organizada y se ha distinguido por ser la sede de los debates de las candidatos en las elecciones para Gobernador del Estado, diputaciones federales y locales y presidentes municipales.

En la administración de Lezama Lomelí se ha logrado consolidar a la FECAPEQ como líder de opinión y voz autorizada para participar en proyectos y toma de decisiones de los tres niveles de gobierno, al tener entre sus filas a los líderes de los 22 colegios de profesionistas, que contribuyen con su análisis especializado en todos los rubros de la Administración pública.

La Presidente de la Federación dijo que hoy, debido a la contingencia por el COVID, el reto es seguir impulsando a los profesionistas en esta etapa de recuperación económica, y continuar haciendo equipo con sociedad y gobierno.